設備資源 Facilities

硬體資源 Hardware Facilities

  2007 IBM
刀鋒伺服器
2008 IBM
刀鋒伺服器
2014 IBM
大型運算主機
2014
異質運算叢集
2014 IBM
刀鋒伺服器
2016 HP
刀鋒伺服器
主機架構 Cluster Cluster SMP Cluster Cluster Cluster
硬體規格 138組計算節點
1238組計算核心
48組計算節點
440組計算核心
2組計算節點 9組 x86計算節點
6組 GPU K40
6組 GPU K80
6組 Phi 7120
32組計算節點
640組計算核心
34組計算節點
680組計算核心
計算節點 HS22: X5650 2.67G 6C兩顆, 24G RAM
HS22: E5540 2.53G 4C兩顆, 32G RAM
HS21: X5355 2.66G 4C兩顆, 16G RAM
HS23: E5-2630 2.3G 6C兩顆, 48G RAM
HS22: E5540 2.53G 4C兩顆, 28G RAM
HS21: E5335 2.0G 4C兩顆,12G RAM
X3850: E7-8870 2.40GHz 10C四顆, 2T RAM ESC4000: E5-2630v2 2.60GHz 6C兩顆, 128G RAM X240: E5-2670v2 2.50GHz 10C兩顆, 128G RAM BL460c G9: E5-2650 v3 2.30GHz 10C兩顆, 128G RAM
網路連線 Infiniband DDR Gigabit Infiniband FDR Infiniband FDR Infiniband FDR 10 GbE
運算效能 12.3 TFlops 4.2 TFlops 3 TFlops 17 TFlops 12.8 TFlops 25 TFlops
作業系統 Windows HPC/Linux Linux Linux Linux Linux Linux
排程軟體 Windows HPC/PBSPro Torque/Maui Torque/Maui Torque/Maui Torque/Maui Torque/Maui
編譯程式 GCC, Intel GCC, Intel GCC, Intel, PGI GCC, Intel, PGI GCC, Intel, PGI GCC, Intel
適合應用 應用程式專用 Sequential programs, OpenMP Large memory required programs, MPI, OpenMP Parallel programs, MPI, OpenMP, CUDA, OpenCL Parallel programs, MPI, OpenMP Parallel programs, MPI, OpenMP
安裝軟體 Discovery/Material Studio, Matlab Open Source Packages, OpenFOAM, R Open Source Packages, VASP, Gaussian, R Open Source Packages, VASP, Gaussian, R Open Source Packages, VASP, Gaussian, R, Gurobi Open Source Packages, VASP, Gaussian, R

軟體資源 Software Facilities

軟體名稱 適用領域
Gaussian 物理、光電、分子、量子化學
VASP 物理、奈米、原子結構
SAS 統計
Matlab 數學、科學計算
Discovery Studio 生物、藥學、分子模擬
Material Studio 化學、材料

軟體版權列表 Discovery Studio

模組名稱 功能領域 版權數目
Analysis 結構分析 2
Biopolymer 生物大分子結構建構 2
CHARMm 生化分子能量及動態運算 1
CHARMm Lite 生化對接分子能量最適化 2
LigandFit 結構對接 2
Ludi 藥效分子基團產生器 2
MODELER 自動化同源蛋白產生器 1
Protein Families 多源蛋白序列比對 1
Protein Health 預測性同源蛋白診斷分析 1
Sequence Analysis 序列比對分析工具 1
TOPKAT 3DQSAR毒性預測模組 1
LigandIScore 配體親和力計算 2
ProteinDock 蛋白質接合模組 1
LibDock 小分子接合模組 1
DS ADMET 化合物特性預測 1
ProteinRefine 蛋白質結構計算優化 1

軟體版權列表 Material Studio

模組名稱 功能領域 版權數目
CASTEP 分子系統密度泛函計算 32
DMol3 Solid State 奈米分子固態量子力學 16
Discover 材料分子系統動態模擬 8
VAMP 分子光譜與能隙 1