探討在急性骨髓性白血病中受NPM1基因突變調節之微小核醣核酸與基因表現調控之間的關係

計畫名稱:探討在急性骨髓性白血病中受NPM1基因突變調節之微小核醣核酸與基因表現調控之間的關係

所屬單位:生醫電資所

研究團隊:生物資訊暨生物統計實驗室

計畫主持人:莊曜宇

研究人員:邱鈺喬

資源需求:MATLAB, R, miRSystem, GSEA, IPA

使用期間:2016/09~

研究主題:
探討在急性骨髓性白血病中受NPM1基因突變調節之微小核醣核酸與基因表現調控之間的關係

研究內容概述:
NPM1基因突變為急性骨髓性白血病中發生比例非常高的一種基因突變,至今該突變在急性骨髓性白血病中之病理生理功能仍不甚明朗。此外,微小核醣核酸(microRNA)可藉由調控基因表現,在許多人類的癌症生成與轉移過程中扮演重要角色。然而,我們發現目前經生物實驗驗證的微小核醣核酸-基因對中,僅有約10%具有顯著的負相關表現。因此我們推斷,微小核醣核酸對於基因表現的調控強度,可能在不同細胞與細胞狀態(如帶有某些基因突變與基因正常)間是動態的。
本計畫為本實驗室與台大醫院血液腫瘤科合作之研究,主旨為探討NPM1基因突變在急性骨髓性白血病中所調節之微型核醣核酸與基因表現之調控現象與機制。藉由整合台大醫院臨床資料、生物資訊分析、生物驗證實驗,本計畫將完成一跨領域的整合性研究。其可分為三個子項目,其一為建立一數學模型,用以有系統地尋找受NPM1基因突變所調節之微型核醣核酸與基因表現之調控機制;其二為整合臨床預後資料與功能性分析,進而有意義的分析與解讀第一階段之統計資料;最後,我們將設計細胞實驗,用以驗證NPM1基因突變對於微型核醣核酸與基因表現關係之調節,以及尋找可能的參與機制。

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