建立轉錄因子和基因雙核心轉錄調控網路以探討毛果楊中參與木材形成的木質素合成基因的調控

計畫名稱:建立轉錄因子和基因雙核心轉錄調控網路以探討毛果楊中參與木材形成的木質素合成基因的調控

所屬單位:生科系

研究團隊:細胞壁基因轉錄調控研究室

計畫主持人:林盈仲

研究人員:徐子述

資源需求:Compiler: GCC Package: Discovery Studio, R

使用期間:2019/01~

研究主題:
建立轉錄因子和基因雙核心轉錄調控網路以探討毛果楊中參與木材形成的木質素合成基因的調控

研究內容概述:
次世代定序分析技術 (next generation sequencing)在近年來在基因組定序或是轉錄組定序都日漸成熟,無論是在精準度的提升或是價格更人性化,而使次世代定序分析技術儼然成為分析全轉錄組的重要工具。我們將使用次世代定序分析技術進行毛果楊乾旱前後的定序,並且分析木質素單體合成基因以及木質部轉錄因子在乾旱前後基因表現量的差異。接著我們使用乾旱下差異表現木質素單體合成基因的啟動子以酵母單雜交系統進行篩選,篩選時將使用我們已經克隆完成的319個轉錄因子文庫,構建出5層在乾旱下的階層轉錄調控網路。我們接著將會以我們團隊已經建立好的染色質免疫沉澱技術結合木質部原生質體轉殖系統\驗證在階層轉錄中每一個轉錄因子與下游基因啟動子結合的正確性,以及定量出每一個轉錄因子活化或是抑制下游基因的程度。我們將從這個5層的階層轉錄調控網路(第一層為木質素單體合成基因,第二層到第五層由轉錄因子構成)中的第2-5層選出兩個調控最多下游基因的轉錄因子進行毛果楊的穩定轉殖。最後我們將分析野生型和轉殖毛果楊在乾旱脅迫下的存活率,並且希望能鑑定出有抗旱能力的轉殖毛果楊。

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