高可靠度的蛋白質與配體嵌合,進行最佳化演算法的特性分析。

計畫名稱:高可靠度的蛋白質與配體嵌合,進行最佳化演算法的特性分析。

所屬單位:資訊系

研究團隊:分子生醫資訊實驗室

計畫主持人:歐陽彥正

研究人員:陳品良

資源需求:BLAST

使用期間:2009/03~

研究主題:
高可靠度的蛋白質與配體嵌合,進行最佳化演算法的特性分析。

研究內容概述:
蛋白質與配體嵌合有兩個主要的挑戰,即能量函數的高維度以及高起伏性。能量函數最主要的特徵在於全域最小值常被一些區域最小值所包圍,因此,如何有效率的辨識潛能函數的全域最小值將會是一個相當大的挑戰。然而,在預測蛋白質與配體間的交互作用時,高維度將會造成更嚴重的問題。因此,最佳化演算法如果沒有特別針對高維度以及高起伏這兩個特性進行設計,很難達到令人滿意的效能。我們採用排名的概念來減緩能量函數的高起伏性,並利用適應性突變機制來控制每個維度的分佈情形。

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